עמותת "המסלול החדש" היא מוסד ללא כוונות רווח (מלכ"ר). כחלק מפעילותה, מגייסת העמותה את משאביה הפיננסיים באופן עצמאי, בין השאר בעזרת תורמים פרטיים, אשר מאמינים בחזון שלה ובמטרותיה. התרומות המתקבלות בעמותה מסייעות לה בתפעול השוטף ובשיפור השירות שהיא מעניקה למען הקהילה.

​

פעילות העמותה מבוקרת מבחינה חשבונאית, משפטית וארגונית, היא מחזיקה באישור ניהול תקין מרשם העמותות וזיכוי תורמים מפטור ממס בהתאם לסעיף 46 לפקודת מס הכנסה.